Čisti i sigurni proizvodi mogu se dobiti molekularnom destilacijom uz jednostavan radni proces i manje opreme. Tehnologija molekularne destilacije može odvojiti supstance koje nije lako odvojiti konvencionalnom destilacijom. Uređaj za molekularnu destilaciju mora osigurati da tlak u sistemu dostigne visok vakuum, da ima visoke zahtjeve za zaptivanje materijala, a razmak između površine koja isparava i površine kondenzacije treba biti umjeren. Obrada opreme je teška, a troškovi su visoki.
Potrošnja energije proizvoda molekularne destilacije je mala. Zbog malog gubitka pregrijavanja u cijeloj separaciji molekularne destilacije, zbog jedinstvenog strukturnog oblika uređaja za molekularnu destilaciju, njegov unutarnji tlak je vrlo nizak i njegov unutarnji otpor je daleko manji od onog kod konvencionalne destilacije, što može uvelike uštedjeti energiju potrošnja.
Za odvajanje materijala visoke točke ključanja, osjetljivih na toplinu i lako oksidiranih materijala, molekularna destilacija pruža najbolju metodu odvajanja. Zato što molekularna destilacija radi na temperaturi daleko ispod tačke ključanja materijala, a vreme zadržavanja materijala je kratko.
Destilirani tečni film molekularne destilacije je tanak, efikasnost prijenosa topline cijelog proizvoda je visoka, vrijeme zagrijavanja materijala je kratko, a udaljenost između zagrijane površine tekućine i površine kondenzacije je manja od prosječnog slobodnog puta svjetlosnih molekula, tako da svjetlosni molekuli koji izlaze s površine tekućine gotovo bez sudara stignu do kondenzacijske površine.
Kako se oprema tornja uglavnom koristi za proces prijenosa mase, potrebno je da dvije faze plin-tečnost budu u potpunom kontaktu kako bi se postigla visoka efikasnost prijenosa mase. Pored ispunjavanja procesnih uslova, treba da ispunjava i sledeće osnovne uslove:
1. proizvodni kapacitet treba da bude veliki. Odnosno, kapacitet rukovanja materijalom po jedinici vremena na dijelu tornja jedinice trebao bi biti velik. Pri velikom protoku plin-tečnost, još uvijek je nepoznato da veliki broj pojava kao što je uvlačenje magle, blokiranje tekućine ili poplava oštećuje normalan rad.
2. visoka efikasnost odvajanja. To jest, gasovita i tečna faza mogu biti u potpunosti u kontaktu i efekat razdvajanja je dobar.
3. operacija je fleksibilna. Ima snažnu prilagodljivost i širok radni opseg. Može se prilagoditi različitim materijalima i održati stabilan rad u slučaju fluktuacije opterećenja, a i dalje ima visoku efikasnost odvajanja.
4. nizak pad pritiska. Odnosno, otpor tekućine koja prolazi je mali, što može uvelike uštedjeti potrošnju energije u proizvodnji i smanjiti troškove. Ako je pad pritiska u vakuumskom tornju prevelik, sistemu će biti teško održati potreban vakuum.
5. Jednostavna struktura, manje potrošnog materijala, jednostavna za proizvodnju i instalaciju, što može smanjiti ulaganja i troškove.
6. Otporan je na koroziju, nije lako blokirati i pogodan za rad, podešavanje i održavanje.
